研究团队所在学科依托南京理工大学应用化学国家重点学科和江苏省化学工程与技术优势学科的生物化工方向。该学科方向是在90年代初的生物化工研究室的基础上发展而来。最先从事的是微生物发酵及其代谢产物的分离纯化应用方面的研究。在此基础上建立了江苏省医药中间体工程中心，在医药中间体的开发应用的基础研究方面做了大量的工作。2002年筹建南京理工大学分子代谢中心并于2006年6月正式成立。 并随后分别列入学校和工信部重点建设计划。该中心是国内较早建立起来的具有一定影响的专门代谢的研究机构。中心以糖脂代谢的分子调控为主要研究方向，在分子遗传和代谢以及生化药学等方面的深入交叉，形成了基础和应用并举的特色。特别是微生物活性多糖的应用的研究极具特色。中心的工作人员大多是在国外实验室工作多年，具有丰富的理论和实践水平。中心还与世界上许多实验室保持着良好合作关系。中心与南京大学生物医药国家重点实验室有密切联系。近年来中心主持和参与了多项包括国家自然科学基金、973、863和其他国家和省部科研项目。实验条件良好，所在实验室，拥有代谢的分子调控、细胞生物学和微生物发酵，代谢产物的化学修饰及改性等所需的先进设备和优良技术。近五年来本团队获得各类奖项3项，获得国内发明专利5项，发表SCI研究论文100多篇。目前团队主要围绕糖脂代谢调控及其代谢产物的分离纯化和应用方面开展工作。其主要研究方向如下：(1)小分子化合物在糖脂代谢中的调控作用及其与代谢相关疾病的基础研究 该研究方向是团队的重点研究方向。生物体内化学小分含量的变化导致一系列的信号传导，从而引起基因表达或关闭，最终影响动物的代谢和行为，是一个新的重要的生物学现象。研究生物节律调控的代谢基因表达的信号传导途径中各个信号分子的调控机制，阐明信号通路，揭示表达信号的生物学意义和功能，将有助于揭开一些代谢疾病的发病机理，并可能使这种信号传导途径成为一个新的治疗代谢疾病的药物靶点。该方向主要以分子生物学技术和化学生物学技术为手段，并与化学其他领域进行深入地交叉，利用一些基因敲除的细胞和动物或微生物模型，从微观到整体上研究一些重要代谢基因和蛋白质的表达调控，探索一些重要疾病过程中物质代谢和能量代谢的异常，理解这些疾病的发生机理，同时为代谢疾病的药物设计提供科学基础。 (2)新型生物活性的微生物多糖的发现及其结构功能、基因调控的研究围绕新型微生物多糖Salecan生产菌株为材料，通过大规模测序技术和生物信息学技术系统研究β-葡聚糖的合成酶及调控体系的基因族。重点分析β-葡聚糖的合成酶GUS1的启动子以及转录调控的分子机制。采用大片段重组技术克隆相关基因，分析其功能。同时也考察定点突变对多糖合成转录的影响。 通过分离纯化各种重组多糖，对这些多糖进行结构解析，分析与外源基因导入产生效应的一致性和变异点，探索其可能的分子机制和改进方法；研究这些新多糖的物化性质和生物活性，重点关注这些重组多糖的免疫活性和抗肿瘤效果。研究其成药特性和分子细胞的药效和药理特征。该研究方向着重研究多糖生物合成的相关酶系及其调控机制，并建立起活性多糖的新的微生物合成表达系统。(3)活性多糖的化学修饰及应用研究 利用实验室丰富的活性多糖的资源，开展非病毒多糖的基因传递载体的研究。用组合化学的方法设计，合成和筛选具有高效转染能力和低细胞毒性的多糖聚合物。水溶性生物可降解类糖类聚合物纳米颗粒，在安全性、毒性、稳定性等方面都优于其他类载体，在体内多种器官与组织的细胞转染效率有的已达到临床的要求。生物可降解性可以增加载体的生物相容性和降低其体内细胞毒性，因此是系统给药所期待的优点，目前该方向在可生物降解的多糖基因传递载体颗粒开发上取得了重要进展。(4)活性多糖的工程应用技术研究开展免疫多糖Salecan的工程应用研究。Salecan 以良好的水溶性，强烈的免疫特性，有望成为一种具有完全自主知识产权的新型微生物多糖。该方向将围绕Salecan的工业化生产技术和应用为重点，研究Salecan在食品、医药、农业、化工、化妆品等方面的应用。目前在开辟治疗皮肤耐药性感染新途径进行了积极有效的探索。研究成果是皮肤耐药性病原菌感染的研究领域的重大突破，具有重要的理论价值和广阔的应用前景，必将产生重大的社会效益和经济效益。
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