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RNA甲基化修饰高通量测序数据的生物信息方法开发以及RNA甲基化修饰调控网络的系统重建 (国家自然科学基金面上项目)

成果编号:20268
价格:面议
完成单位:西交利物浦大学
单位类别:其他高校
完成时间:2017年
成熟程度:研制阶段
服务产业领域: 电子信息、生物技术与医药
发布人:孟佳 离线
随着高通量测序技术的发展特别是MeRIP-Seq技术的问世, RNA表观遗传学获得了更多的关注。近期的研究结果表明,RNA的6-甲基腺膘呤修饰m6A参与调控细胞分化、RNA剪切和蛋白质翻译等重要功能。 在丰富前期工作的基础上,本项目力图进一步完善针对RNA甲基化测序组学数据的生物信息学方法和工具,包括:MeRIP-Seq和RNA BS-Seq数据的质量控制和误差校正、更具统计效力的差异甲基化分析模型、RNA修饰的可视化方法以及不同种修饰的组合模式等等。本项目的核心内容重点关注RNA甲基化谱的调控手段,拟利用非参量贝叶斯网络生成模型系统重建RNA甲基化修饰位点受相关酶基因调控的网络机制,并进一步探索该系统调控机制在疾病治疗和药物靶点筛选中的可能应用。 本项目的顺利实施将为RNA甲基化相关领域的研究项目提供关键的表观转录层面基因调控网路信息以及一系列针对RNA修饰组学数据的有效工具
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成果介绍

科技计划:
成果形式:
合作方式:人才培养
参与活动: 2022年高校院所走进镇江产学研合作对接活动
专利情况: 未申请专利
成果简介
综合介绍
随着高通量测序技术的发展特别是MeRIP-Seq技术的问世, RNA表观遗传学获得了更多的关注。近期的研究结果表明,RNA的6-甲基腺膘呤修饰m6A参与调控细胞分化、RNA剪切和蛋白质翻译等重要功能。 在丰富前期工作的基础上,本项目力图进一步完善针对RNA甲基化测序组学数据的生物信息学方法和工具,包括:MeRIP-Seq和RNA BS-Seq数据的质量控制和误差校正、更具统计效力的差异甲基化分析模型、RNA修饰的可视化方法以及不同种修饰的组合模式等等。本项目的核心内容重点关注RNA甲基化谱的调控手段,拟利用非参量贝叶斯网络生成模型系统重建RNA甲基化修饰位点受相关酶基因调控的网络机制,并进一步探索该系统调控机制在疾病治疗和药物靶点筛选中的可能应用。 本项目的顺利实施将为RNA甲基化相关领域的研究项目提供关键的表观转录层面基因调控网路信息以及一系列针对RNA修饰组学数据的有效工具
创新要点
技术指标
本项目拟在生物信息、生物统计方法、癌症领域发表论文8-16篇(其中SCI期刊文章4-8篇,中科院分区二区以及以上至少4篇),培养博士或硕士研究生3-6人,并建成一个RNA甲基化修饰测序数据的系统处理平台,提供一系列相关的数值分析结果和生物机制预测。
其他说明
完成人信息
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