长期从事湿地生态与生态工程研究工作,先后主持国家污染控制与治理科技重大专项(简称重大水专项)、国家重点基础研究发展计划(简称973计划)、国家高技术研究发展计划(简称863计划)课题级任务,中欧科技合作、国家基金委面上项目、World Wild Fund for Nature项目等国家与国际项目30余项,参与国家基金委重大、重点项目、国家重点科技攻关项目、各类省部级项目等50多个。发表科研论文330余篇,其中SCI论文122篇;获得授权技术发明专利25项;著作、教材11部;省部级奖励3项;入选教育部跨世纪优秀人才培养计划(2002)、江苏省六大高峰人才计划(2003)与江苏省优秀青年教师计划(1994)。
近五年来,在长三角地区和淮河流域,已经完成水生植物恢复重建工程、自然湿地保护与修复工程、湖泊湿地与湖滨带生态工程、河道生态修复与污染削减功能重建工程、湿地景观工程、水质改善工程、湿地污水生态处理工程、湿地植物工具种大规模扩繁、湿地有机农业等方面生态工程示范项目60多项。2012年,创办了全国第一家政产学研合作型的“南京大学常熟生态研究院”以及“江苏省湿地修复工程实验室”。